Kjo drejtori ka ne përbërjen e saj 11 sektorë:

• Sektori  i  Kontrollit Tatimor dhe Analizës së Riskut
• Sektori i Verifikimit në Terren (1,2,3,4)
• Sektori i Vleresimit  te Detyrimit Tatimor (1,2,3,4)
• Sektori i Manaxhimit te Borxhit Tatimor
• Sektori i Administritmit te Tregjeve

Objektivi kryesor i punës së kesaj Drejtorie është hartimi, implementimi dhe kontrolli i sistemeve të qarta për përpunimin e deklaratave të tatimpaguesve, vlerësimi i detyrimeve tatimore që duhen vlerësuar, përcakton kriteret për përzgjedhjen e tatimpaguesve mbi bazën e analizës së riskut për t’iu nënshtruar kontrollit tatimor, mbledh informacion dhe fakte mbi evazionin tatimor dhe mashtrimin.